L’état de santé des témoins

a été confirmé par un canceronet.com examen

médical annuel, un entretien en personne et l’examen du même questionnaire sur le mode de vie que celui donné aux cas. Tous canceronet.com les dossiers numériques de cas et de contrôles ont été anonymisés et entrés dans une base de données d’étude (“DCP DB”). Tableau 1 caractéristiques des participants (cas et témoins) Pleine taille de la table Le mode de vie des données Les entrevues de tous les cas (N = 300) et de tous les témoins (n = 300) ont été réalisées par un intervieweur qualifié à l’aide d’un questionnaire structuré en français comprenant des questions sur la démographie, les antécédents médicaux généraux canceronet.com

individuels et familiaux, les antécédents de cancer individuels et familiaux et le mode de vie, y compris l’alimentation quotidienne et hebdomadaire, le tabac, l’alcool et l’activité physique. La taille et le poids du sujet ont été mesurés avant la chirurgie pour les cas et lors d’un examen de santé annuel pour les témoins. L’apport alimentaire moyen a été

• étudié par un ensemble de questions semi-quantitatives sur la fréquence des aliments. Les individus ont été classés comme consommateurs de viande” élevés “si la” viande “
• totale (le total de la viande rouge et transformée, du poisson et de la volaille) consommée était d’au moins 150 g/jour. Les consommateurs “riches” en matières grasses sont ceux qui consomment plus de 200 g de matières grasses animales, d’huile,
• de beurre, de fromage et de fruits secs, 3 fois par semaine ou plus. Les individus ont été classés comme consommateurs” élevés “de fruits et légumes si la fréquence était de 5 fois ou plus par

semaine et ont été canceronet.com classés

comme consommateurs” élevés ” de saumure (légumes transformés, fruits et viande) si le sujet consommait au moins 150 g/jour 3 fois ou plus par semaine. Consommation de tabac (y compris le canceronet.com narguilé et le tabagisme) statut (“jamais utilisé”, “ancien utilisateur” ou “utilisateur actuel”), âge de la première consommation de tabac, période de tabagisme et nombre de cigarettes/narguilés par jour ont été enregistrés. Aux fins de la présente étude, “ancien utilisateur” et “utilisateur actuel” ont été classés comme “utilisateur”du tabac. L’état de consommation d’alcool (”jamais buveur“,” ancien buveur “ou” buveur actuel”) et

• la fréquence moyenne de consommation ont été enregistrés. Aux fins de cette étude, “ancien buveur” et “buveur actuel” ont été classés comme “consommateur”d’alcool.
• L’activité physique a été évaluée en fonction du nombre d’heures par jour et de jours par semaine. le niveau d’activité physique “élevé” était défini par Plus de 2 heures par jour et au moins 5 jours par semaine. La nature du travail du sujet (physique ou non) a été
• prise en considération lors canceronet.com de la définition d’un niveau d’activité physique “élevé”. Tous les facteurs liés au mode de vie et aux habitudes inclus dans cette étude ont été classés

conformément aux principes définis dans le système Trig de Phenx Toolkit [19]. Toutes les réponses aux questionnaires des sujets ont été transcrites et validées par du personnel de projet qualifié et enregistrées dans le PD du PCD. Évaluation de la pertinence fonctionnelle des variations génétiques de KCNB1 Les implications fonctionnelles potentielles sur la

de deux traitement du cancer variants

• du gène KCNB1 et d’un indel apparenté ont été prédites à L’aide de SNPnexus [20]. Les prédictions fonctionnelles fournies par SNPnexus ont été examinées par les variantes
• non codantes FitCons et GWAVA. Les calculs de fitCons donnent une probabilité de “conséquences de fitness ” mutationnelles qui intègre des informations provenant à la
• fois de données évolutives et de données génomiques fonctionnelles (ARN-seq, ChIP-seq et DNase-seq) et est traitement du cancer particulièrement adapté pour quantifier l’effet des mutations sur les

éléments cis-régulateurs dans L’ADN non codant [21]. Le score de fitCons est considéré comme significatif à p < 0,003 (”score hautement significatif”) avec des scores plus élevés indiquant une modification fonctionnelle génomique plus probable [22]. GWAVA produit trois scores (Region, traitement du cancer TSS et Unmatched) à partir de trois approches différentes. Comme

dans les études précédentes [23], nous utilisons un seuil de l’un quelconque des trois scores, > 0,5 pour suggérer des variantes avec des implications fonctionnelles probables. Génotypage de KCNB1 L’ADN génomique a été préparé par QIAamp® DNA blood mini Kit, selon les instructions du fabricant (Qiagen GmbH, Hilden, Allemagne). Le génotypage de

deux SNP, traitement du cancer localisés dans

le 3’UTR de KCNB1 (rs3331, rs1051295), a été effectué à L’aide D’ARMS-PCR et vérifié par séquençage Sanger direct. Alors que la délétion d’insertion à proximité (rs11468831) était amplifiée par PCR simple suivie d’une électrophorèse capillaire sur le Bioanalyseur Agilent 2100 (Bio-analyseur Agilent 2100, Biotech Vertriebsgesellschaft m. b. H Agilent Technologies, Lituanie). Tous les génotypes, séquences et contrôles ont été validés par du personnel de projet qualifié et enregistrés dans la base de données DCP. L’analyse statistique Toutes traitement du cancer les données de l’étude ont été enregistrées et stockées dans la base traitement du cancer

de données de l’étude (DCP DB). La qualité des données et l’évaluation globale ont été effectuées par un statisticien qualifié expert en examen des données d’étude. Les fautes de frappe, les artefacts, les données manquantes et les statistiques anormales ont été évalués par l’équipe du projet et les décisions de corriger les données ont été approuvées après l’examen de la source originale. Les décisions d’exclure les données ou les dossiers de sujets ont été prises par l’équipe d’analyse des données composée du responsable de

• l’étude, du directeur opérationnel et du responsable statistique. Après examen des données, les données et les enregistrements “approuvés” ont été notés pour une
• analyse statistique ultérieure. La Distribution des caractéristiques cliniques des patients atteints de CRC a été résumée en utilisant la fréquence et le pourcentage. Deux échantillons de test T et de test du Chi carré de Pearson ont été utilisés pour évaluer les
• différences dans les caractéristiques démographiques et de mode de vie entre les patients atteints de CRC et

les témoins Sante pour les

• variables continues et catégorielles respectivement. Les modèles de régression logistique bivariée et multivariable ont été adaptés au CRC et séparément aux données de cohorte RC et CC afin d’évaluer si les génotypes démographiques, de mode de vie ou liés à
• KCNB1 sont associés au CRC, au RC ou au CC. Les modèles ont été adaptés après ajustement aux facteurs de style de vie pour tester la robustesse des associations. De
• plus, nous avons testé Sante l’haplotype de l’association KCNB1 contre tous les facteurs. À partir de chaque modèle

ajusté, les rapports de cotes (Ro), les intervalles de confiance correspondants à 95% et les valeurs p ajustées ont Sante été extraits. Toutes les valeurs p calculées étaient à double face et les valeurs p inférieures au niveau de signification prédéfini (alpha = 0,05) étaient considérées statistiquement significatives. Toutes les analyses statistiques ont été

effectuées Sante à L’aide

de RStudio (Ver. 1.1.456) et R (Ver. 2.14.0) [24, 25]. Résultat Clinique Les caractéristiques clinicopathologiques des sujets CRC (Tableau 1.) sont tels que l’hypertension (74.30%), l’anémie (24.30%) et le diabète (24.70%). La plupart des cas de CRC se présentent sous forme d’adénocarcinome Lieberkuhnien (81%), bien différencié (55%) et au niveau du site Sante du côlon (63,30%). CRC Dukes staging assigné selon la classification TNM de L’UICC était I (0,30%), II (41%), III (40%) et IV (18,70%). La

majorité des sujets du CRC ont été traités chirurgicalement suivis d’une chimiothérapie (63,30%). Les témoins n’avaient pas d’incidence de cancer ou de clinicopathologies et, comme prévu dans le plan d’étude apparié, l’âge moyen et l’indice de masse corporelle (IMC) n’étaient pas statistiquement différents entre les cas de CRC et les témoins (p > 0,09), bien que les Sante réquences selon le sexe étaient statistiquement différentes p < 0,001 (Tableau 2).